Science ouverte
Le laboratoire AAU s’engage en faveur de la Science ouverte et s’inscrit pleinement dans le Plan national initié en 2018 par le ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
AAU s’est lancé depuis le milieu des années 2000 dans le mouvement en faveur du libre accès à la littérature scientifique via l’archive ouverte institutionnelle HALSHS. Depuis janvier 2020, le règlement intérieur du laboratoire mentionne l’obligation de déposer dans les collections HAL AAU toute publication issue de ses membres.
A partir de 2016 et de la publication de la Loi pour une République numérique, de nombreuses actions de sensibilisation auprès des chercheur.e.s ont été mises en œuvre : enquête d’usages, journée d’études sur les questions éthiques, formation Opidor Tour, journées Médici sur l’édition en contexte Science ouverte.
Engagement pour la Science ouverte
L’engagement du laboratoire AAU s’appuie sur trois axes :
1. AAU soutient l’archive ouverte HAL
AAU souhaite rendre obligatoire auprès de ses membres le dépôt du texte intégral des articles de revues, dans le cadre juridique favorable de la Loi pour une République numérique d’octobre 2016. Il peut être effectué dans les 6 mois pour les STM (sciences, techniques et médecine) ou 12 mois pour les SHS (sciences humaines et sociales), à compter de la date de la première publication par l’éditeur.
Pour les dépôts de chapitres d’ouvrages ou d’articles de colloques, il convient de se rapprocher des éditeurs d’ouvrages ou des organisateurs de colloques afin de recueillir leur accord.
Dans la lignée de la feuille de route du CNRS, le laboratoire se donne l’objectif de 100% d’articles de revues en libre accès d’ici 2025, soit par le fait de l’éditeur, soit par l’accessibilité aux fichiers via l’archive HAL, soit les deux.
Cet objectif répond également aux exigences des principales agences de financement, ANR et Horizon Europe, qui imposent le libre accès aux articles de revues issus des recherches qu’elles financent ainsi que le dépôt des données associées autant que possible.
2. AAU favorise un accès ouvert aux publications scientifiques qui encourage la bibliodiversité et l’innovation
L’intégrité et la valeur scientifique reposent sur le peer reviewing. AAU ne prend pas en charge les frais de publication sous forme d’APC (article processing charges – frais demandés parfois à l’auteur·rice pour publier en open access) et rejette le modèle hybride (revues sous abonnement qui proposent des frais de publication pour publier en open access des articles individuels).
AAU est un laboratoire multidisciplinaire dont les membres publient à parts égales dans des revues scientifiques, des ouvrages collectifs et des actes de conférences. AAU reconnait l’importance des ouvrages au regard des critères de reconnaissance symbolique de ses domaines de recherche.
AAU souhaite une prise en compte de l’ensemble de ses résultats dans leur diversité, leur qualité et leurs impacts attendus ou observés, dans le cadre des recommandations de la Déclaration de San Francisco. Les actualités sur les publications du site AAU témoigne de cette pluralité éditoriale.
3. AAU accompagne ses membres dans la rédaction de plans de gestion des données
Le plan de gestion des données (PGD) est un document qui précise :
- la gestion des données de la recherche pendant et à l’issue du projet ;
- quelles données vont être collectées ou générées ;
- si elles seront en libre-accès et comment ;
- comment ces données vont être archivées et conservées.
Prendre en compte la question des données personnelles
Pour s’engager dans les principes d’ouverture par défaut des données de recherche mais également pour répondre aux règles qui s’appliquent pour la protection des données personnelles ou des données relevant du droit d’auteur, une appropriation collective du Règlement général sur la protection des données (RGPD) est à l’œuvre dans les équipes avec l’aide du Délégué à la protection des données (DPO) nommé pour le laboratoire.
Adapter un Plan de Gestion des Données à nos disciplines
De nombreuses agences de financement de la recherche, dont l’Agence nationale de la recherche (ANR), demandent désormais la fourniture d’un plan de gestion des données à 6 mois puis au terme du projet. AAU souhaite personnaliser ces modèles dans le cadre de sa politique, en les enrichissant par des exemples et recommandations adaptés à son environnement de recherche, afin que les chercheurs perçoivent ce document comme faisant partie intégrante de leurs pratiques de recherche.
Stocker de façon sécurisée
AAU impose le stockage sécurisé sur un serveur interne dédié aux données numériques et documents issus des projets de recherche.
Ce serveur est adapté aux besoins des équipes de recherche qui souhaitent stocker et partager leurs données avec une gestion d’accès. Il est également destiné aux doctorants et stagiaires qui doivent y déposer leurs données de recherche notamment avant leur départ du laboratoire.
Il est demandé à tout membre du laboratoire d’appliquer des conventions de nommage, des arborescences de dossiers, de séparer données brutes des données analysées, d’utiliser des formats ouverts et pérennes.
Sélectionner pour archiver durablement et partager
AAU invite tout porteur de projet à anticiper son projet d’archivage en relation avec l’équipe support du laboratoire et l’appui de la TGIR Huma-Num et/ou Huma-Num Loire. Pour ce faire, les membres du laboratoire pourront s’inspirer du tableau de gestion des archives historiques du laboratoire qui détermine leur règle de conservation et d’élimination pour le versement aux Archives départementales.
Le projet d’archivage sera analysé et préparé en amont de la recherche afin d’organiser les données, de décrire le type de données (métadonnées), les formats, la volumétrie, la durée d’archivage, les droits associés, en suivant les recommandations sur les formats proposés par la TGIR Huma-Num en lien avec le CINES. Ce projet garantira l’intégrité, la lisibilité, l’intelligibilité des données en fonction du projet de recherche dans le cadre duquel elles ont été produites et des objectifs du déposant. Huma-Num attribue des identifiants pérennes aux données qui faciliteront leur accessibilité et leur citabilité.
Le baromètre de la Science Ouverte 2023 de l’UMR AAU
Après avoir publié en janvier 2022 une adaptation du Baromètre français de la Science Ouverte (BSO) avec l’assistance d’étudiants de Centrale Nantes, l’UMR bénéficie depuis 2023 du soutien du service bibliométrie de Nantes Université pour mettre en place son baromètre. Le calcul du texte intégral se fonde sur les DOI crossref et sur les identifiants HAL. Les thèses sont intégrées grâce à leur numéros NNT.
Cet outil accompagne le déploiement de la politique de l’UMR en faveur de l’accès ouvert, et permet d’en mesurer les effets sur le long terme.
On observe que pour l’ensemble des années, le % d’ouverture a augmenté très nettement. Pour les publications 2022, 85% sont déjà accessibles en texte intégral grâce au dépôt rapide de la part des chercheurs (41 publications sur 81) dans HAL. A titre de référence le taux national pour 2022 est de 65% dont 18% du fait des éditeurs.
Les conférences (14 publications) de 2022 sont 100% en libre accès, dont 7% par les éditeurs. Le taux de chapitres en texte intégral a fortement augmenté en passant de 13 à 63 % (10 chapitres concernés). Notons que 10% sont dû à l’éditeur. Un ouvrage a été déposé dans HAL pour l’année 2022. Le mouvement du libre accès gagne peu à peu les monographies.
On peut observer une très nette progression de l’ouverture des publications en français par rapport à l’année précédente (de 36 à 81%). Les publications en langue française ont presque atteint le taux de publication en langue anglaise (91%) et ce principalement grâce aux dépôts dans HAL.
93 % (1 point de plus qu’en 2022) des publications scientifiques AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, parues en 2022 qui sont diffusées en accès ouvert par leur éditeur, sont accompagnées d’une licence libre. Au sein des licences libres, c’est la licence CC-BY qui est majoritaire avec 61 % des publications (17 publications sur 28).
Très forte augmentation en 2023 (38 points !) avec 75 % des publications scientifiques parues en 2022 en texte intégral dans HAL. A titre de référence le taux national en 2023 est de 59%.
Le travail de dépôt rétrospectif a permis d’augmenter le taux de texte intégral de 8 à 15 % en fonction des années. Ainsi, entre 2022 et 2023, le taux des publications parues en 2017 qui sont hébergées sur HAL est passé de 51 % à 61 %. Cela peut s’expliquer par un embargo qui se lève, les dépôts au fil de l’eau ou rétroactifs et la participation aux défis-dépôts (CasuHALthon et HALugathon).
Les deux dernières années 2021 et 2022 restent incomplètes. Cependant le taux d’ouverture en 2022 est supérieur à la moyenne nationale. Thèses.fr et HAL permettent d’accéder à la majorité des thèses soutenues au sein de l’UMR depuis 2014.
Baromètre de la Science Ouverte 2022 de l'UMR AAU
Après avoir publié en janvier 2022 une adaptation du Baromètre français de la Science Ouverte (BSO) avec l’assistance d’étudiants de Centrale Nantes, l’UMR a bénéficié en 2023 du soutien du service bibliométrie de Nantes Université pour mettre en place son baromètre. AAU fait partie des 70 universités et laboratoires qui se sont lancés dans cette déclinaison locale du BSO intégrant ainsi une communauté d’échange et d’entraide.
Cette nouvelle édition bénéficie des évolutions apportées par la version 3 du BSO national (2023) qui prennent davantage en compte les publications propres aux sciences humaines et sociale, à savoir :
- les publications sans DOI (remplacé par l’identifiant HAL) ;
- les thèses (grâce à leur n° NNT) ;
- de nouveaux types de documents (Jeux de données, Codes et logiciels).
Répartition des publications scientifiques de l’UMR AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, en accès ouvert par voie d’ouverture et par année de publication (observé en 2022)
On observe que, pour les publications parues en 2021, 16 % sont ouvertes via les deux voies (éditeur et archives ouvertes), 26 % uniquement via une archive ouverte et 10 % uniquement via l’éditeur.
Taux d’accès ouvert par type de publications de l’UMR AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, publications de 2021
Ce graphique présente le taux d’accès ouvert de 4 types de publications, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, au regard de l’ensemble des publications parues en 2021. Il précise, pour chacun, quelles sont les voies d’ouverture empruntées. Les pratiques de diffusion des prépublications des actes de conférence sur des plateformes ouvertes dédiées expliquent que leur taux d’accès ouvert avoisine les 100 %. On remarque notamment que le baromètre mesure un ratio de 77 % d’accès ouvert pour les articles de revue, et 13 % d’accès ouvert pour les chapitres d’ouvrage. Les initiatives d’accès ouvert ont en effet historiquement démarré par les revues et les articles. Les ouvrages et les chapitres sont moins engagés dans le processus d’ouverture.
Taux d’accès ouvert par langue de publications de l’UMR AAU avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, publications 2021
Parmi les publications, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, 45 sont en français dont 16 ouvertes et 29 fermées (soit un taux d’accès ouvert de 36 %), et 42 en anglais dont 30 ouvertes et 12 fermées (soit un taux de 71 %). Les publications en langue française sont donc moins ouvertes que les publications en langue anglaise. Les publications du laboratoire en espagnol, allemand et portugais représentent de plus petits effectifs, statistiquement moins significatifs.
Répartition des publications scientifiques de l’UMR AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, par type de licence utilisée parmi les publications en accès ouvert chez l’éditeur
92 % des publications scientifiques AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, parues en 2021 qui sont diffusées en accès ouvert par leur éditeur sont accompagnées d’une licence libre, avec 46 % des publications sous licence CC-BY.
Taux de publications scientifiques de l’UMR AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, ouvertes et hébergées sur une archive ouverte par année d’observation (HAL)
En décembre 2022, 37 % des publications AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, parues en 2021 étaient en accès ouvert (texte intégral) dans l’archive ouverte HAL (34 dépôts sur 91). Ceci peut s’expliquer par le dépôt de notice seule (chapitre d’ouvrage…), la politique de publication et d’autoarchivage des revues (accès fermé ou embargo), la non conservation des PDF auteurs.
Évolution du taux de publications scientifiques de l’UMR AAU, avec un DOI Crossref ou un identifiant HAL, hébergées sur une archive ouverte, par année d’observation (HAL)
Les pics de 2016 et 2020 s’expliquent en partie par le dépôt des actes du congrès international Ambiances dans la collection dédiée et celui de 2018 par la présence d’une médiatrice HAL au sein de l’équipe.
Taux d’ouverture des thèses de doctorat de l’UMR AAU par année de soutenance (observé en 2022)
Le taux d’ouverture de 100% des thèses préparées au sein du laboratoire pour la majorité des années est supérieur à la moyenne nationale. Depuis septembre 2016, le docteur ne peut s’opposer à la diffusion de sa thèse, mais celle-ci peut être soumise à embargo. Pour l’année de soutenance la plus récente sur le graphique, les données ne sont que partielles.
Proportion de publications de l’UMR AAU qui mentionnent la création de leur code ou logiciels
Ce graphique montre, par année de publication, la proportion de publications pour lesquelles une mention de création de code ou logiciels a été détectée. La mise à disposition des codes source des logiciels, avec la possibilité de les modifier, les réutiliser et les diffuser, est un enjeu majeur pour permettre la reproductibilité des résultats scientifiques et soutenir le partage et la création de connaissances. Cette détection est réalisée grâce à une analyse automatique du texte intégral par l’outil Softcite : 19 publications sur 34 en texte intégral en 2021 sont concernées.
Baromètre de la Science Ouverte 2020 de l'UMR AAU (2015-2020 mesuré en 2022)
Proportion des publications de l’UMR AAU en accès ouvert entre 2015 et 2020 mesurée en janvier 2022
L’accès ouvert totalise l’accès aux fichiers des publications par les sites éditeurs et par la collection HAL de l’UMR. Sur les presque 1500 publications publiées entre 2015 et 2020, 62% étaient disponibles en accès ouvert en janvier 2022.
En 2020, sur presque 120 publications, le taux d’accès ouvert est de 72,2% pour les 4 types de publications, ce qui par rapport à la moyenne des 5 dernières années offre une progression de 10%. Les publications en accès ouvert par le biais des sites éditeurs doublent par rapport à cette même moyenne, passant de 4,2% à 8,3 %.
La moyenne nationale est de 62% mais ne concerne que les publications d’articles avec DOI. « Selon l’édition 2021 du Baromètre de la Science Ouverte (BSO), 62 % des 166 000 publications scientifiques françaises publiées en 2020 sont en accès ouvert en décembre 2021 ».
Nombre de publications par genre pour l’UMR AAU en 2020 mesuré janvier 2022
Dans la continuité de la ventilation des publications par genre sur les 5 dernières années, les communications dans un congrès sont majoritaires mais il est intéressant de noter que les chapitres d’ouvrage sont de plus en plus disponibles en accès ouvert. Ce chiffre est à regarder de près les années à venir avec la mise en application des nouvelles directives du Plan S, mettant en œuvre le libre accès immédiat à toutes les publications financées par les organismes de financement dont l’ANR.
Taux d’accès ouvert des publications de l’UMR AAU par domaine en 2020 mesuré en janvier 2022
Sur les 5 dernières années le taux d’accès ouvert varie entre 40 et 52 % selon les disciplines. Les publications dans le domaine informatique sont prépondérantes dans cette démarche.
Taux d’accès ouvert aux publications de l’UMR AAU par éditeur en 2020
Visualisation des 20 premiers éditeurs par quantité de publications
Nombre de publications de l’UMR AAU par domaines en 2020 mesuré en janvier 2022
Les publications déposées relèvent majoritairement du champ SHS. L’informatique est le 2d domaine pour 2020 dans la continuité des chiffres pour les années 2015-2020.
Le baromètre du laboratoire AAU : un outil de pilotage de la Science Ouverte
Une des spécificités de notre baromètre est sa capacité à intégrer toutes les publications disponibles en libre accès y compris celles ne disposant pas de DOI. La collection HAL de l’UMR est l’unique base pour récupérer les références des publications publiées. L’API d’Unpaywall, pour les publications disposant d’un DOI (Digital Object Identifier), est utilisé en complément et dans un second temps pour enrichir les métadonnées : nom d’auteur, titre de la revue, éditeur, domaines et sous-domaines, date, statut open access, …
Le baromètre porte uniquement sur 4 types de publication : article de revue, communication dans un congrès, chapitre d’ouvrage et direction d’ouvrage. L’ensemble des publications référencées a été extrait durant le mois de janvier 2022.
Les sources des données, la méthodologie et le code utilisés pour réaliser ce baromètre reprennent ceux du baromètre science ouverte proposé par l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (BSO UVSQ), développé par Maxence Larrieu, lui-même inspiré du baromètre français de la Science ouverte du MESRI (BSO MESRI). La méthode adoptée, le code développé et les résultats obtenus sont disponibles.
Le baromètre est mis à jour annuellement.
- Travail réalisé pour le laboratoire AAU, entre septembre et décembre 2021, par les étudiants Alan Roussel et Alexandre Bodet avec l’aimable complicité de Maxence Larrieu.
- Ce travail a été soutenu le 7 janvier 2022 dans le cadre d’un cours de l’option informatique de l’Ecole Centrale de Nantes, encadré par Myriam Servières.
- Suivi : Laurence Bizien, Laurent Charrieau, Véronique Dom.
La méthode adoptée, le code développé et les résultats obtenus sont disponibles sur la plateforme Github.